●特征1. 延伸性UP
・以基因组DNA为模板最大可扩增40kb的片段
・实现了30 sec/kb的高速循环(粗样品推荐1min/kb)
・最适用于高GC含量目的片段的扩增
此外,还适用于使用抗体的热启动法,可进行特异性良好的扩增。
●特征2. 对粗样品的扩增性能UP
・提高了对植物裂解液、小鼠尾巴的扩增效率
・降低了土壤成分、食品成分等的PCR抑制效果
・与基础版产品KOD FX一样,可对革兰氏阳性菌、酵母、霉菌等直接进行PCR
KOD DNA Polymerase具有卓越的延伸性,同时对粗样品成分中的抑制物质有很强的抵抗力。
KOD FX就是利用这种特性而开发出来的高成功率PCR酶,该酶在难扩增序列及粗样品的扩增方面受到了广泛的好评。
然而,以KOD FX为代表的以往的PCR酶在20~30个循环以后,很容易出现扩增无法持续的<停滞现象>,PCR的功能无法完全发挥出来。
【KOD FX Neo】是在KOD FX的基础上,应用了本公司新开发的【延伸增强剂】技术,从而成功地抑制了<停滞现象>,进一步提高了对长目的片段、难扩增序列及粗样品等的扩增效率。
1. 扩增长度的比较
使用KOD FX Neo及以往的产品,以人基因组DNA为模板进行长链目的片段的扩增。结果显示,只有使用KOD FX Neo的情况下,才可以确认扩增40kb长的目的片段。另外,与以往产品相比,KOD FX Neo只需一半的延伸时间(30sec/kb) *。因此,可以极大地缩短反应时间。
*粗样品扩增时建议按1min/kb进行。
2. 检测灵敏度的比较
以人基因组DNA为模板进行检测灵敏度的比较。结果可见,与原产品相比,KOD FX Neo的灵敏度提高了约10倍。
3. 扩增的比较
以碱裂解法制备的鼠尾裂解液为样品,扩增3种小鼠的基因。结果可见,只有用KOD FX Neo才能得到良好的扩增。像这样,KOD FX Neo能够对样品进行直接PCR,可以省略掉繁杂的纯化过程。
使用96孔PCR板的鼠尾处理方法(碱裂解法)
将鼠尾(约3 mm)放入离心管中。
↓←添加50 mM NaOH 180μl,盖上盖子,用Vortex充分振荡
↓spin down(轻轻地振荡使液体落到管下部)
↓95℃, 10 min.孵育(使用Thermo cycler)
↓←添加1 M Tris-HCl (pH 8.0) 20μl,盖上盖子,用Vortex充分振荡
↓spin down(轻轻地振荡使液体落到管下部)
取0.5〜2μl上清(模板)添加到50μl反应体系中进行PCR反应
※鼠尾切片,请切得小一些,使之能够浸没在裂解液中。
※请注意热碱。
※处理后,鼠尾不会完全溶解。大约只能溶解鼠尾的表面。
※本方法,可使用1.5m的离心管。
4.腐殖酸添加实验
腐殖酸(humic acid)是存在于腐殖土及土壤中的红褐色或黑褐色有机物质,对PCR有抑制作用。
通常进行的DNA纯化过程中不能去除这种腐殖酸,因此,以环境、生态体系中的样品作为模板进行PCR非常困难。
这里,以人基因组DNA中混入腐殖酸为例,探讨了其对PCR的抑制作用。结果显示,KOD FX Neo对抗腐殖酸的能力最强。
因此,使用KOD FX Neo可以对环境、生态体系中的样品进行PCR。